Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
E2F1Q01094 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms