Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ERVV-2B6SEH9 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms