Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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SH3BP1Q9Y3L3 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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SH3BP1Q9Y3L3 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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SH3BP1Q9Y3L3 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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SH3BP1Q9Y3L3 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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