Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
TRAPPC9Q96Q05 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms