Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 MYB-206ENST00000420123 1051 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 TRMT2B-AS1-201ENST00000443801 205 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC020763.5-201ENST00000623298 430 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
VAMP3Q15836 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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