Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RFTN1Q14699 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms