Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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CDH18Q13634 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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CDH18Q13634 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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CDH18Q13634 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 OR6X1-201ENST00000327930 1058 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CDH18Q13634 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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