Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TCIRG1Q13488 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms