Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 Z82198.3-201ENST00000421145 199 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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TOP3AQ13472 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC116917.1-201ENST00000520558 305 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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TOP3AQ13472 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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TOP3AQ13472 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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TOP3AQ13472 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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TOP3AQ13472 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TOP3AQ13472 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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