Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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HOXD13P35453 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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HOXD13P35453 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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HOXD13P35453 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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HOXD13P35453 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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HOXD13P35453 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXD13P35453 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
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