Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 AL035443.1-202ENST00000442841 586 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRDP23468 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRDP23468 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
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