Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 MAGEB16-204ENST00000399989 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTPRAP18433 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
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