Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RFXAPO00287 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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