Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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SH3BP1Q9Y3L3 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
SH3BP1Q9Y3L3 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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SH3BP1Q9Y3L3 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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SH3BP1Q9Y3L3 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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SH3BP1Q9Y3L3 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SH3BP1Q9Y3L3 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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