Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
CCDC93Q567U6 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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