Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 FABP1-201ENST00000295834 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 SCGB1D1-201ENST00000306238 453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CASP10-206ENST00000374650 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CREM-213ENST00000374734 711 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 PPP1R7-204ENST00000402734 883 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL136968.2-201ENST00000407959 354 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MIR1296-201ENST00000408136 92 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP169-201ENST00000411124 291 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL353803.3-201ENST00000444641 335 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 OR4A47-201ENST00000446524 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL031736.1-201ENST00000449688 618 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 IGHV3-64-201ENST00000454421 431 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RNF7P1-201ENST00000478598 342 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC008799.1-201ENST00000495909 457 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC02160-201ENST00000503577 517 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 IGHV3-36-201ENST00000520848 401 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC023403.1-202ENST00000521139 759 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC138123.3-201ENST00000551928 791 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 PCED1B-AS1-209ENST00000552269 673 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC01397-201ENST00000554808 579 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC145350.2-201ENST00000561541 821 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 APOC1-202ENST00000588750 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC016590.1-201ENST00000588763 420 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC005176.1-203ENST00000597077 532 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ZSCAN30-210ENST00000601405 510 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.72-201ENST00000617458 278 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC244196.1-201ENST00000620569 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC239859.6-201ENST00000622095 213 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CCP110-202ENST00000396208 5151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TRIM49-202ENST00000532501 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 NRCAM-203ENST00000379024 5782 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TTTY8B-201ENST00000328819 531 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ANKRD39Q53RE8 TTTY8-201ENST00000329684 531 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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