Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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COL24A1Q17RW2 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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COL24A1Q17RW2 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 FCF1P7-201ENST00000451185 558 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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COL24A1Q17RW2 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
COL24A1Q17RW2 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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COL24A1Q17RW2 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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COL24A1Q17RW2 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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COL24A1Q17RW2 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
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COL24A1Q17RW2 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
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COL24A1Q17RW2 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
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COL24A1Q17RW2 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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COL24A1Q17RW2 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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COL24A1Q17RW2 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL24A1Q17RW2 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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