Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
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ECM1Q16610 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
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ECM1Q16610 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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ECM1Q16610 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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ECM1Q16610 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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ECM1Q16610 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 TCEANC2-201ENST00000234827 10436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
ECM1Q16610 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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