Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC079880.2-201ENST00000603790 1213 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
VPS72Q15906 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms