Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
NCF4Q15080 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms