Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 PSMC1P13-201ENST00000458195 985 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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ITGA9Q13797 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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ITGA9Q13797 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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ITGA9Q13797 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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ITGA9Q13797 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ITGA9Q13797 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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