Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 OR5AK3P-201ENST00000527486 1297 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CUL4AQ13619 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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