Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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ITGB3BPQ13352 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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ITGB3BPQ13352 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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ITGB3BPQ13352 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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ITGB3BPQ13352 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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ITGB3BPQ13352 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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ITGB3BPQ13352 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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ITGB3BPQ13352 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
ITGB3BPQ13352 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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