Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
TRIM28Q13263 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
TRIM28Q13263 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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