Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CHAF1AQ13111 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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