| FOXD4 | Q12950 | AL670729.3-201 | ENST00000602345 | 574 nt | TSL 4 BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC091057.3-201 | ENST00000602684 | 733 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC108738.1-201 | ENST00000603703 | 237 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC018754.1-201 | ENST00000607486 | 925 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AL355816.2-201 | ENST00000610049 | 647 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | C1orf185-204 | ENST00000612209 | 899 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC093875.1-201 | ENST00000623688 | 504 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AP003485.1-201 | ENST00000625093 | 753 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | FRG1EP-201 | ENST00000634469 | 770 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC099654.9-201 | ENST00000637055 | 678 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC087565.3-203 | ENST00000641018 | 837 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | LINC01808-202 | ENST00000641680 | 1116 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | PABPC1P6-201 | ENST00000445594 | 1829 nt | BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | USP8-204 | ENST00000425032 | 3559 nt | TSL 2 BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | ADAM18-202 | ENST00000379866 | 2314 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | CASC19-201 | ENST00000500112 | 5735 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | ANK2-202 | ENST00000357077 | 14196 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AFTPH-204 | ENST00000409933 | 2811 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | KATNA1-202 | ENST00000335647 | 1684 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | ANKRD34C-201 | ENST00000421388 | 4951 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | CNTN5-212 | ENST00000619298 | 5734 nt | TSL 5 BASIC | 5.08 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | GSTM2-206 | ENST00000442650 | 1478 nt | TSL 5 BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | MAP3K19-203 | ENST00000375845 | 4369 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | CNTRL-205 | ENST00000373850 | 5824 nt | TSL 2 BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | NPSR1-AS1-202 | ENST00000419766 | 4821 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC016716.1-201 | ENST00000265882 | 708 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | CAPZA3-201 | ENST00000317658 | 1087 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RNA5SP507-201 | ENST00000363603 | 121 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RNA5SP30-201 | ENST00000365552 | 115 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | LEMD1-203 | ENST00000367152 | 741 nt | TSL 2 BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | SPRR2G-201 | ENST00000368748 | 568 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | NT5C3A-206 | ENST00000409787 | 840 nt | TSL 2 BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RN7SKP125-201 | ENST00000410481 | 302 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC008154.2-201 | ENST00000420268 | 414 nt | TSL 3 BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | MTCYBP24-201 | ENST00000420387 | 1106 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | LINC01690-201 | ENST00000424837 | 576 nt | TSL 2 BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC115285.1-201 | ENST00000424879 | 736 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC127526.2-201 | ENST00000426436 | 775 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | Z82246.1-201 | ENST00000428201 | 457 nt | TSL 2 BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RPS27AP12-201 | ENST00000429552 | 465 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | LINC00894-203 | ENST00000432696 | 298 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AL772161.1-201 | ENST00000439130 | 476 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AL591848.2-201 | ENST00000442712 | 522 nt | TSL 3 BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AL929288.2-201 | ENST00000446368 | 407 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | LRRC37A14P-201 | ENST00000452297 | 462 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RPS23P6-201 | ENST00000466136 | 431 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC004884.2-201 | ENST00000476569 | 546 nt | TSL 4 BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC087672.1-201 | ENST00000479876 | 766 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | GAPDHP36-201 | ENST00000480688 | 918 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC079841.1-201 | ENST00000481228 | 950 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | LINC02215-201 | ENST00000503320 | 543 nt | TSL 4 BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC010230.1-202 | ENST00000506265 | 592 nt | TSL 5 BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC020593.1-201 | ENST00000507399 | 299 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | TCP11X3P-202 | ENST00000514289 | 1254 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | IGHV3-32-201 | ENST00000519182 | 355 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | PKIA-AS1-203 | ENST00000522807 | 692 nt | TSL 3 BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | OSBPL9P2-201 | ENST00000526582 | 1228 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | CDKN3-206 | ENST00000541304 | 1070 nt | TSL 2 BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | HAUS8P1-201 | ENST00000549005 | 542 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC006270.2-201 | ENST00000578523 | 652 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC012588.1-201 | ENST00000583852 | 358 nt | TSL 3 BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | ELSPBP1-205 | ENST00000597519 | 557 nt | TSL 3 BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC008687.2-201 | ENST00000597865 | 520 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC015849.3-201 | ENST00000603981 | 488 nt | TSL 5 BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AL009028.1-201 | ENST00000604895 | 802 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC099785.1-201 | ENST00000605697 | 437 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC245041.2-202 | ENST00000613389 | 493 nt | TSL 5 BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AL121890.3-201 | ENST00000618494 | 516 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC073342.3-201 | ENST00000624211 | 193 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC012594.1-272 | ENST00000625790 | 710 nt | TSL 5 BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | VIPR1-AS1-223 | ENST00000627073 | 451 nt | TSL 5 BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | MEG8-222 | ENST00000637332 | 1237 nt | TSL 5 BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | NUP155-202 | ENST00000381843 | 4200 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | UGT2A2-202 | ENST00000604629 | 1676 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | TESPA1-203 | ENST00000524622 | 4188 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | HSPD1P14-201 | ENST00000432666 | 1618 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | TMEM68-209 | ENST00000521229 | 2400 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | SEC31A-209 | ENST00000500777 | 3610 nt | TSL 5 BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | TMEM38B-201 | ENST00000374688 | 3956 nt | TSL 2 BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | CYP4Z2P-201 | ENST00000423332 | 1512 nt | BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | MYO9A-209 | ENST00000564571 | 8111 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | DNAH7-202 | ENST00000409063 | 1845 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.07 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | KCNT2-206 | ENST00000609185 | 3622 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | ZNF732-202 | ENST00000619749 | 2179 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | ACE2-202 | ENST00000427411 | 3507 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | ZNF700-202 | ENST00000482090 | 3113 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | LINS1-214 | ENST00000561308 | 1612 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AC073136.1-201 | ENST00000449426 | 2884 nt | BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RNA5SP394-201 | ENST00000364216 | 119 nt | BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | PAGE2B-202 | ENST00000374974 | 456 nt | TSL 5 BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RNU6-468P-201 | ENST00000384003 | 109 nt | BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AMMECR1LP1-201 | ENST00000415152 | 841 nt | BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AK4P4-201 | ENST00000419465 | 646 nt | BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | LINC01945-201 | ENST00000419784 | 840 nt | TSL 2 BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AL359853.3-201 | ENST00000423879 | 544 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | MTCO2P23-201 | ENST00000425216 | 680 nt | BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AL662874.1-201 | ENST00000426065 | 230 nt | BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | AP000695.2-201 | ENST00000428667 | 715 nt | TSL 5 BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | TXNDC12-AS1-201 | ENST00000428794 | 391 nt | TSL 3 BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |
| FOXD4 | Q12950 | RPL34P6-201 | ENST00000432390 | 345 nt | BASIC | 5.06 | □□□□□ -1.6 | | |