Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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FOXD4Q12950 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
FOXD4Q12950 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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