Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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CASQ1P31415 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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CASQ1P31415 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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CASQ1P31415 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CASQ1P31415 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CASQ1P31415 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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