Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
PTPREP23469 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 BPIFC-203ENST00000397452 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 OR51M1-203ENST00000642046 4092 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 ZNF407-202ENST00000309902 5595 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 FDPSP5-201ENST00000399474 1057 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC026826.1-201ENST00000493002 361 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC008147.2-201ENST00000552061 4713 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 ACTG1P15-201ENST00000570019 1063 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC068418.1-201ENST00000582990 404 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 GPRIN3-201ENST00000333209 6260 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 ABLIM3-201ENST00000309868 4326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
PTPREP23469 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 SNORA70G-201ENST00000383923 142 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 PDE11A-203ENST00000409504 2102 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AL021937.4-201ENST00000444848 444 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC108676.1-201ENST00000455557 2969 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC139713.2-204ENST00000511042 342 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
PTPREP23469 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
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