Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SHOC2Q9UQ13 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
SHOC2Q9UQ13 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms