Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SEMA4CQ9C0C4 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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