Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 DZIP3-201ENST00000361582 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 TPD52-203ENST00000448733 4339 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 KIAA0040-206ENST00000619513 4340 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 HBS1L-212ENST00000527578 2618 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
FOXQ1Q9C009 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms