Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 ZNF542P-202ENST00000467807 3209 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 TAF7L-203ENST00000372907 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
GRIK4Q16099 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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