Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 SLC16A12-AS1-201ENST00000423474 405 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 SLC8A1-AS1-207ENST00000444629 935 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 ZSWIM7-209ENST00000486655 726 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 HMGN1P17-201ENST00000513734 295 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC021242.2-202ENST00000522129 545 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 OCM2-201ENST00000257627 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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