Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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CHD4Q14839 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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CHD4Q14839 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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CHD4Q14839 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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CHD4Q14839 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
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CHD4Q14839 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
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CHD4Q14839 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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CHD4Q14839 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
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CHD4Q14839 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
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