Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 THAP6-209ENST00000507556 1134 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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IFT88Q13099 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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IFT88Q13099 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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IFT88Q13099 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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IFT88Q13099 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
IFT88Q13099 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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