Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AC135068.11-201ENST00000636378 921 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 NXF2B-202ENST00000602195 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 ADH1B-205ENST00000625860 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AL512353.3-201ENST00000417517 1326 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 TDRD1-201ENST00000251864 4510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AL669831.5-205ENST00000429505 441 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 RN7SL849P-201ENST00000485236 295 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AC130366.1-201ENST00000526505 1192 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
KCNH2Q12809 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms