Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 METTL9-211ENST00000615720 2890 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 OR6M2P-201ENST00000529831 871 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CYP4F3Q08477 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms