Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ACADSBP45954 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.5 ms