Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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HOXD10P28358 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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HOXD10P28358 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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HOXD10P28358 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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HOXD10P28358 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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HOXD10P28358 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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HOXD10P28358 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
HOXD10P28358 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
HOXD10P28358 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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