Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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