Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 ZNRD1ASP-221ENST00000637794 1074 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
USP35Q9P2H5 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
USP35Q9P2H5 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms