Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms