Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AL929410.2-201ENST00000451170 189 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC022973.2-201ENST00000520146 549 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
VAMP3Q15836 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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