Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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SS18Q15532 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SS18Q15532 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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SS18Q15532 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SS18Q15532 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SS18Q15532 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SS18Q15532 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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