Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHD4Q14839 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
CHD4Q14839 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.4 ms