Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC079630.1-201ENST00000412812 585 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
DDX39BQ13838 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
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DDX39BQ13838 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
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DDX39BQ13838 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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DDX39BQ13838 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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DDX39BQ13838 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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DDX39BQ13838 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
DDX39BQ13838 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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