| RUNX3 | Q13761 | OR2AH1P-201 | ENST00000425717 | 928 nt | BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC112715.1-201 | ENST00000445534 | 350 nt | TSL 3 BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | Z95327.1-201 | ENST00000446082 | 482 nt | BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL162151.2-201 | ENST00000448875 | 158 nt | BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL355613.1-201 | ENST00000451856 | 480 nt | TSL 2 BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR9N1P-201 | ENST00000491296 | 333 nt | BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC105460.2-202 | ENST00000502936 | 825 nt | TSL 2 BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02488-201 | ENST00000504287 | 652 nt | TSL 2 BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AL359219.2-201 | ENST00000555184 | 348 nt | BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AP002360.3-201 | ENST00000607673 | 710 nt | BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092953.2-201 | ENST00000608000 | 699 nt | BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KLRF1-208 | ENST00000617889 | 1241 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | VPS29-212 | ENST00000621131 | 1124 nt | TSL 3 BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PDCD6IPP1-202 | ENST00000622242 | 1064 nt | BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010608.2-201 | ENST00000624830 | 470 nt | BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01002-227 | ENST00000633363 | 541 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091948.2-201 | ENST00000636510 | 279 nt | BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IQCH-202 | ENST00000358767 | 3062 nt | TSL 5 BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CEP192-201 | ENST00000325971 | 7764 nt | TSL 5 BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ATP2C1-212 | ENST00000507488 | 3579 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IQGAP2-203 | ENST00000396234 | 3376 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SCRG1-201 | ENST00000296506 | 4420 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | STXBP4-204 | ENST00000434978 | 2807 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CPXCR1-202 | ENST00000373111 | 1577 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.4 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OSBPL6-201 | ENST00000190611 | 10513 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02389-201 | ENST00000535058 | 3546 nt | TSL 2 BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC087565.3-202 | ENST00000642085 | 1603 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PIGN-241 | ENST00000640050 | 3154 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KIAA0586-202 | ENST00000354386 | 5226 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NFIB-203 | ENST00000380934 | 2142 nt | TSL 2 BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL672167.1-204 | ENST00000641875 | 3017 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NRIP1-201 | ENST00000318948 | 7556 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CLEC7A-203 | ENST00000310002 | 425 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR8G1-201 | ENST00000341493 | 936 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP74-201 | ENST00000362849 | 309 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GTSF1L-201 | ENST00000373003 | 835 nt | APPRIS P3 BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GTSF1L-202 | ENST00000373005 | 459 nt | APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL359837.1-201 | ENST00000381357 | 287 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRGV8-201 | ENST00000390343 | 468 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SKP202-201 | ENST00000410439 | 330 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNORA74C-2-201 | ENST00000411179 | 201 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR8G2P-201 | ENST00000412796 | 908 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SETP10-201 | ENST00000424368 | 814 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL445528.1-201 | ENST00000426330 | 420 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC062021.1-201 | ENST00000429008 | 557 nt | TSL 4 BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CDY14P-201 | ENST00000431260 | 1014 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS26P4-201 | ENST00000431743 | 355 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TNKS2-AS1-201 | ENST00000432246 | 609 nt | TSL 2 BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CDY12P-201 | ENST00000440679 | 1015 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS15AP29-201 | ENST00000445539 | 400 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CDY13P-201 | ENST00000445813 | 1015 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL591623.2-201 | ENST00000449978 | 222 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CDY23P-201 | ENST00000451661 | 1014 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL7P22-201 | ENST00000466005 | 733 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PLSCR5-202 | ENST00000482567 | 1018 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008415.1-201 | ENST00000522189 | 734 nt | TSL 5 BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL352979.3-201 | ENST00000553515 | 247 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00871-202 | ENST00000556071 | 554 nt | TSL 3 BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C14orf2-211 | ENST00000557040 | 472 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00254-201 | ENST00000563416 | 662 nt | TSL 3 BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CHEK2P2-203 | ENST00000566448 | 670 nt | TSL 5 BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC245389.1-201 | ENST00000605141 | 529 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL121904.1-201 | ENST00000611894 | 948 nt | TSL 5 BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR8069-1-201 | ENST00000616627 | 86 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR8069-2-201 | ENST00000621412 | 86 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007546.2-201 | ENST00000623996 | 360 nt | BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AJ009632.2-203 | ENST00000634708 | 1205 nt | TSL 5 BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FGD4-210 | ENST00000525053 | 2925 nt | TSL 2 BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NUDT12-202 | ENST00000507423 | 1781 nt | TSL 2 BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TC2N-203 | ENST00000435962 | 5146 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRIM77-201 | ENST00000398290 | 1353 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ABCA13-204 | ENST00000435803 | 17184 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 4.39 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FANCI-202 | ENST00000310775 | 4743 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CD69-201 | ENST00000228434 | 1676 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CSMD3-203 | ENST00000343508 | 13018 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | KCNJ6-201 | ENST00000609713 | 19645 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | THEMIS-204 | ENST00000537166 | 3830 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01520-201 | ENST00000441457 | 1487 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | C12orf50-203 | ENST00000550553 | 1525 nt | TSL 5 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ENSAP1-201 | ENST00000392855 | 326 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC079630.1-201 | ENST00000412812 | 585 nt | TSL 4 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EBLN1-201 | ENST00000422359 | 1208 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CR848007.2-201 | ENST00000424918 | 787 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL390879.2-203 | ENST00000426943 | 1121 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | BMS1P19-201 | ENST00000433925 | 393 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL590762.3-201 | ENST00000436372 | 640 nt | BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008080.4-202 | ENST00000440034 | 1005 nt | TSL 3 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HGF-207 | ENST00000453018 | 721 nt | TSL 3 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL035409.1-201 | ENST00000454305 | 497 nt | TSL 2 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC121764.3-201 | ENST00000465946 | 384 nt | TSL 2 BASIC | 4.38 | □□□□□ -1.71 | | |