Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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TCIRG1Q13488 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
TCIRG1Q13488 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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