Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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IFT88Q13099 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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IFT88Q13099 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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IFT88Q13099 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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IFT88Q13099 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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IFT88Q13099 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 OR52J1P-201ENST00000450596 932 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
IFT88Q13099 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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