Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
GPS1Q13098 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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